Стоя на плечах гигантов, или зачем нужны консорциумы | Герман Демидов скачать в хорошем качестве

Стоя на плечах гигантов, или зачем нужны консорциумы | Герман Демидов

Герман Демидов (Centre for Genomic Regulation, The Barcelona Institute of Science and Technology, Universitat Pompeu Fabra) За последние десятилетия развитие биологии было связано с накоплением массивов данных, огромных настолько, что отдельные исследовательские группы уже не справлялись с их биоинформатическим анализом. С целью решить эту проблему начали создаваться консорциумы из десятков лабораторий, такие как Human Genome Project, 1000GP, ENCODE и другие. На сегодняшний день, благодаря таким коллаборациям, в открытом доступе есть данные разнообразных типов, полученных с помощью различных технологий, вследствие чего сравнение новых экспериментальных данных с уже существующими стало стандартной частью любого исследования. Важно заметить, что консорциумы производят не только данные, но и биоинформатические пайплайны для их обработки, и стандартные форматы, и процедуры оценки качества. На этой лекции мы обсудим, как работает консорциум, как пользоваться результатами их работы и что делать, если вы вдруг обнаружили себя членом такого консорциума и вам нужно обрабатывать террабайты данных, а потом обмениваться результатами со всеми остальными участниками.