Топология ДНК || Число связей || Скручивание || Скручивание скачать в хорошем качестве

Топология ДНК || Число связей || Скручивание || Скручивание

#биологияанимация Топология ДНК относится к суперспиральным структурам или клубкам в двойной спирали ДНК. Существует два основных типа ДНК: линейная и замкнутая кольцевая. В случае линейной ДНК распутывание возможно благодаря свободному вращению концов ДНК. Однако, как правило, линейная ДНК связана с белками, поэтому распутывание невозможно. Распутать две цепи замкнутой кольцевой ДНК невозможно. Фундаментальный топологический параметр ковалентно замкнутой кольцевой ДНК называется числом зацепления (Lk). Число зацепления показывает, сколько раз одну цепь необходимо пропустить через другую, чтобы две цепи полностью отделились друг от друга. Число зацепления — это сумма двух геометрических составляющих, называемых скручиванием и изгибом. Скручивание — это количество раз, которое одна цепь полностью обвивает другую. Скручивание больше нуля в правой спирали и меньше нуля в левой спирали. Другим топологическим компонентом является скручивание (writhe). Скручивание (writhe) определяет количество пересечений двойной спирали ДНК в трёхмерном пространстве. Для правой спирали скручивание будет отрицательным, а для левой — положительным. Скручивание может быть переплетенным и спиральным. Как известно, в двойной спирали ДНК на один виток приходится 10,5 пар оснований. Таким образом, число зацеплений равно числу пар оснований, делённому на 10,5. ДНК в клетках имеет отрицательную суперспирализацию. Степень суперспирализации измеряется разницей между Lk и Lk not, которая называется разностью зацеплений. ДНК называется отрицательно суперспирализованной, если дельта Lk меньше нуля, и положительно суперспирализованной, если дельта Lk больше нуля. Плотность суперспирали измеряется отношением дельта lk к lk not. Она обозначается символом сигма. Существуют ферменты, способные изменять топологию ДНК, называемые топоизомеразы. Топоизомераза типа I увеличивает число связей на 1, тогда как топоизомераза типа II изменяет число связей на 2.