Caso de Estudio 2 | Módulo 2 Selección Positiva | Curso Metagenómica: De 0 a 100% скачать в хорошем качестве

Caso de Estudio 2 | Módulo 2 Selección Positiva | Curso Metagenómica: De 0 a 100%

🧬 Caso de Estudio 2: Detección de Selección Positiva con PAML y HyPhy | Curso Metagenómica: De 0 a 100% En este caso de estudio del Módulo II (Genética de Poblaciones y Evolución Molecular) exploramos cómo distinguir si los cambios observados en proteínas son producto del azar evolutivo o de la selección natural, utilizando herramientas empleadas en investigación de alto impacto científico. A través de datos reales —incluyendo la proteína Spike de SARS-CoV-2 y genes MHC Clase I en primates— el estudiante recorre el flujo completo desde la teoría neutral de Kimura hasta el análisis computacional reproducible. 📚 CONTENIDO PRINCIPAL ✅ Teoría Neutral de Kimura y bases del reloj molecular ✅ El cociente evolutivo ω = dN/dS (Ka/Ks) como prueba de selección ✅ Sustituciones sinónimas vs no sinónimas y su interpretación evolutiva ✅ Modelos de codón de máxima verosimilitud (MG94 y GY94) ✅ Modelos de sitio en PAML (M0, M1a, M2a, M7, M8) ✅ Pruebas estadísticas LRT y análisis Bayesiano Empirical Bayes (BEB) ✅ Modelo Branch-Site: detección de selección específica por linaje ✅ Métodos complementarios en HyPhy: • FEL • MEME • FUBAR • SLAC • BUSTED • aBSREL ✅ Interpretación biológica de resultados evolutivos reales 🧪 CASOS DE ESTUDIO ANALIZADOS 🔬 Proteína Spike de SARS-CoV-2 Selección positiva episódica asociada a variantes virales (VOC) Mutaciones adaptativas en el dominio RBD Comparación multi-método PAML + HyPhy 🧬 MHC Clase I en primates Replicación moderna del hallazgo clásico de Hughes & Nei (1988) Selección positiva en regiones de reconocimiento antigénico (ARS) ⚙️ PIPELINE COMPUTACIONAL COMPLETO 1️⃣ Alineamiento consciente de codones (MACSE) 2️⃣ Limpieza del alineamiento (trimAl) 3️⃣ Reconstrucción filogenética ML (IQ-TREE) 4️⃣ Modelos evolutivos en PAML (codeml) 5️⃣ Análisis Branch-Site por variantes 6️⃣ Validación cruzada con HyPhy 7️⃣ Visualización e interpretación de resultados Carpeta a descargar: https://unilibrebog-my.sharepoint.com... 🎯 COMPETENCIAS DESARROLLADAS • Detectar selección positiva en genes reales • Interpretar correctamente valores dN/dS y ω • Ejecutar pipelines evolutivos reproducibles • Validar resultados mediante múltiples métodos estadísticos • Conectar señales evolutivas con función estructural y biológica 📝 DOCUMENTO DE APOYO COMPLETO Incluye fundamentos teóricos, guía paso a paso del pipeline, datasets reales, ejercicios prácticos y análisis reproducibles. Duración estimada: 4–5 horas (teoría + práctica computacional) 💼 SERVICIOS BIOSERYL • Bioinformática y análisis ómicos • Ciencia de datos aplicada a biología molecular • Implementación ISO HSEQ / ISO 22000 • Capacitación especializada en bioinformática y metagenómica 📞 CONTACTO 📧 contacto@bioseryl.com 📱 +57 323 421 4453 🌐 www.bioseryl.com 🎓 CURSO COMPLETO Metagenómica: De 0 a 100% Módulo II — Genética de Poblaciones y Evolución Molecular #Metagenomica #EvolucionMolecular #SeleccionPositiva #PAML #HyPhy #dNdS #Bioinformatica #Filogenia #GeneticaDePoblaciones #CursoMetagenomica #BioSeryl #CienciaDeDatos #SARSCoV2 #MHC #Phylogenetics #MolecularEvolution #EducacionCientifica