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三维基因组学的技术实现与应用研究

主讲人：刘涵博士，2008 年于北京林业大学获理学学士学位；2011 年和 2016 年于中国农业大学分别获农学硕士、农学博士学位。博士后。2019 年 4 月入职中科院植物所。前期工作以共同一作发表于 Nature Comm 与 BMC Plant Biology。长期致力于植物三维基因组学研究，独立在国内创建并发表 ChIA-PET、HiChIP、improved 4C-seq 等。发明新型的 Genotyping-By-Sequencing 与 CUT&Tag 方法。对基因组中的远程调控元件如 enhancer 与 super-enhancer 的起源、结构与功能，对单细胞多组学水平的发育轨迹、相变产生与作用、TF-motif、染色质外环状 DNA 及 RNA 介导的 3D 互作等兴趣浓厚。另外的兴趣是，根据待研究的具体科学问题，有针对性地开发新颖的技术方法。 介绍 3D 基因组学的研究对象、研究方法，及其在动植物上的应用。介绍 3D 视角下的生理、病理与进化上的研究进展，特别是以（超级）增强子互作与癌症产生的关联的新颖现象。由于演讲人长期研究植物（玉米），因此也将介绍调控具体农艺性状的基因在营养组织与生殖组织中的互作异同，及在大刍草驯化为现代玉米过程中的 3D 结构变异。