Análisis de microarrays con R: Introducción, análisis de la calidad y preprocesamiento con RMA. скачать в хорошем качестве

Análisis de microarrays con R: Introducción, análisis de la calidad y preprocesamiento con RMA.

En este tutorial vemos una introducción al análisis de microarrays, la técnica más clásica en transcriptómica. Material disponible en mi github: https://github.com/fran-romero-camper... Cubriremos los siguientes puntos: (1) Analizaremos datos de microarrays affymetrix descargardos desde GEO en formato CEL. (2) Instalaremos los paquetes affy, affyPLM, simpleaffy, limma y annaffy. (3) Los datos se cargarán a la sesión de R con la función ReadAffy. (4) Se realizará un análisis de la calidad con función qc. (5) Los datos se preprocesarán para eliminar ruido con rma. (6) Se extraerá la matrix de expresión con exprs. (7) Se calculará la matrix de expresión media y se previsualizará la comparación condición de interés vs control con scatter plots.