Анализ обогащения набора генов (GSEA) с помощью fgsea — простое руководство по R скачать в хорошем качестве

Анализ обогащения набора генов (GSEA) с помощью fgsea — простое руководство по R

В этом уроке я расскажу, как выполнить анализ обогащения набора генов на основе результатов анализа дифференциальной экспрессии генов. Мы будем использовать пакет R fgsea(), и вы научитесь: Установить и запустить fgsea() Подготовить набор данных к выполнению GSEA Задать параметры анализа и запустить его. Просмотреть результаты GSEA и получить красивые графики! И, как всегда, вы можете найти код, который я использую в этом уроке, на сайте biostatsquid.com, где также есть пошаговое объяснение кода. Для этого урока вам понадобится R или Rstudio, а также установить пакет fgsea(). Надеюсь, вам понравится! https://biostatsquid.com/fgsea-tutori... ----------------------------------------------------------------------------------------------------- Уже смотрели? Если вам понравилось это видео или оно было полезным, пожалуйста, дайте мне знать! Ваши комментарии и отзывы очень ценны😊 Если у вас есть вопросы, не стесняйтесь оставлять их в комментариях ниже, я отвечу вам как можно скорее :) -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Вы интересуетесь биостатистикой и вычислительным анализом? Больше инструментов и ресурсов для биостатистики вы можете найти на сайте: https://biostatsquid.com/ Подпишитесь на меня в Instagram: @biostatsquid:   / biostatsquid   Чтобы узнать больше: • простые и понятные объяснения методов биостатистики • инструменты вычислительной биологии • простые пошаговые руководства на R и Python для анализа и визуализации биологических данных! Не забудьте подписаться, чтобы не пропустить мои новые видео! -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Другие интересные ресурсы по анализу обогащения путей: Другие интересные ресурсы по GSEA: Главная страница GSEA: https://www.gsea-msigdb.org/gsea/inde... Подробнее о самом методе: https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas... Сравнительная статья по методам анализа обогащения путей: https://www.nature.com/articles/s4159... Музыка с #Uppbeat (бесплатно для авторов!): https://uppbeat.io/t/pecan-pie/east-s... Лицензионный код: 80ZOLNQ8NSDSWKFV