Стыковка гема с белком с помощью AutoDock Vina | Объяснение стыковки металлокомплексов скачать в хорошем качестве

Стыковка гема с белком с помощью AutoDock Vina | Объяснение стыковки металлокомплексов

В этом уроке я объясняю, как выполнить молекулярный докинг лиганда металлокомплекса, такого как гем, с белком с помощью MGLTools и AutoDock Vina. Видео охватывает подготовку лиганда, подготовку белка, настройку сетки, выполнение докинга и анализ результатов с использованием только бесплатных инструментов с открытым исходным кодом. Этот урок идеально подходит для студентов и исследователей, работающих с металлопротеинами, которым нужен практичный и надежный рабочий процесс докинга без использования платного программного обеспечения. Файл конфигурации: receptor=protein.pdbqt ligand=heme.pdbqt out=output.pdbqt center_x=29.884 center_y=-22.664 center_z=8.185 size_x=40 size_y=40 size_z=40 exhaustiveness=8 Команды: "C:\The Scripps Research Institute\vina\vina.exe" --config conf.txt --log log.txt "C:\The Scripps Research Institute\vina\vina_split.exe" --input out.pdbqt "C:\Program Files (x86)\The Scripps Research Institute\Vina\vina.exe" --config conf.txt --log log.txt "C:\Program Files (x86)\The Scripps Research Institute\Vina\vina_split.exe" --input output.pdbqt