Объединение классификаторов скачать в хорошем качестве

Объединение классификаторов

В этом уроке обучающего курса FS2K мы выйдем за рамки анализа отдельных маркеров и научимся идентифицировать сложные популяции клеток с множественной позитивностью. Вы узнаете, как объединить существующие классификаторы в составной классификатор и проверять редкие биологические события с помощью расширенных инструментов визуализации QuPath. В этом видео мы рассмотрим: ☑️ Фенотипическую логику: понимание того, как QuPath обрабатывает иерархические классификации (например, идентификация клетки как Т-хелперной клетки и PD-1-положительной). ☑️ Мастерство верификации: использование интерфейса просмотра каналов и видимости классов для двойной проверки редких фенотипов, таких как двойная позитивность CD8/FOXP3. ☑️ Стратегию автоматизации: как превратить ручные действия в лаконичный скрипт Groovy для одновременной обработки сотен изображений. ☑️ Пакетная проверка целостности: почему функция «Запустить для проекта» — единственный безопасный способ применения автоматического анализа к сохраненным файлам данных. 00:00 - Догоняющий этап: Загрузка резервных копий проектов и синхронизация файлов 01:41 - Ограничения эксклюзивных классификаторов 03:31 - Создание составного классификатора для фенотипов с несколькими маркерами 04:27 - Важность порядка классификаторов и согласованности именования 06:12 - Проверка результатов составного классификатора на вкладке «Аннотации» 07:35 - Интерпретация эксклюзивных и общих показателей популяции 08:43 - Очистка списка классов: заполнение из существующих объектов 10:33 - Поиск редких клеток: скрытие классов с помощью пробела 12:15 - Пример из реальной жизни: идентификация двойных положительных результатов CD8/FOXP3 14:15 - Устранение неполадок сегментации: помехи от соседних пикселей 16:33 - Использование средства просмотра каналов для мультиплексного анализа 18:46 - Общие скрипты: использование пользовательского интерфейса видимости классов 19:53 - Визуализация комбинаций подмножеств с помощью обнаружения "Заполнение" 22:36 - Сортировка и фильтрация таблицы измерений обнаружения 24:43 - Идентификация ячеек с наибольшей/наименее высокой интенсивностью для проверки 27:41 - Создание скриптов для конвейера: от измерений к классификации 30:35 - Создание скрипта автоматизации из 3 строк 33:10 - ОЗУ против диска: пакетная обработка с помощью "Запуск для проекта" 35:28 - Гигиена кода: сила комментирования ваших скриптов Groovy Пошаговое руководство по обучению: https://saramcardle.github.io/FS2K/Se... Скрипты сообщества: найдите «Пользовательский интерфейс видимости классов» и многое другое на форуме Image.sc: https://forum.image.sc/t/qupath-scrip... Совет: используйте журнал важности переменных в качестве проверки научной обоснованности — убедитесь, что ваши данные обусловлены антителами, а не фоновым шумом. Скачать данные и резервные копии проектов можно здесь: https://drive.google.com/drive/u/0/fo...