3D-анализ органоидов — Урок 3 — Морфологический анализ и проверка гипотез скачать в хорошем качестве

3D-анализ органоидов — Урок 3 — Морфологический анализ и проверка гипотез

Узнайте, как тщательно проверять биологические гипотезы, используя морфологические признаки из данных 3D-органоидов. Мы анализируем влияние осмотического стресса на клетки рака поджелудочной железы, сравнивая изотонические и гипертонические условия с помощью соответствующих статистических методов. В этом руководстве мы работаем с набором данных (2062 клетки) из эксперимента по изучению осмотического стресса. Мы проверяем, влияет ли гипертоническая среда (повышенная концентрация соли) на морфологию клеток — в частности, на объем клеток, округлость, удлинение и компактизацию хроматина. Вы узнаете, когда использовать параметрические, а когда непараметрические тесты, как рассчитывать размеры эффекта, применять поправки на множественное тестирование и интерпретировать результаты с биологической точки зрения. КОД: Доступен здесь: https://github.com/bnsreenu/3D-Organo... ССЫЛКА НА СТАТЬЮ (для данных): Ong, H.T., et al. (2025). Digitalized organoids: integrated pipeline for high-speed 3D analysis of organoid structures. Nature Methods, 22, 1343–1354.